兄弟和刘暄等人眼见皇帝日益失德，行为乖张荒诞，便萌生出了废掉皇帝另立新君的念头。然而，由于各方利益难以协调一致，他们始终犹豫不决，迟迟未能下定决心。就在众人相互争执、举棋不定之时，他们的密谋竟然不慎泄露出去，最终导致江氏兄弟在永元元年（公元 499 年）惨遭诛杀。
江氏兄弟的死讯传来，整个朝堂为之震动。萧遥光和徐孝嗣二人更是惶恐不安，如坐针毡。到了永元元年八月丙辰日（公元 499 年 9 月 3 日），原本萧宝卷打算任命萧遥光为司徒，并让他返回自己的府邸。但此时的萧遥光早已风声鹤唳，草木皆兵，他深知此番进宫领旨极有可能是有去无回，于是心生恐惧，不敢贸然入宫。于是就在当天率先发动了起兵叛乱这一惊天动地的举动，消息传到宫中，萧宝卷急忙召见徐孝嗣以及其他一众官员入宫守卫皇宫和各个城门，并另外派遣萧坦之前去征讨萧遥光。经过一番激烈的战斗之后，萧遥光的叛乱很快便被成功地平定下来。而在此之后没多久，徐孝嗣因功得到晋升，荣升为司空一职。
然而，尽管位高权重，但徐孝嗣内心深处却始终无法安定下来。原来，在叛乱发生期间，他曾经试图寻找机会与沈文季共同商讨应对之策，可是令人遗憾的是，沈文季似乎一直在刻意回避这个话题，使得两人之间的交流难以深入开展。不仅如此，当他获得司空这一高位之后，更是多次推辞谦让，表示自己无意担任此职，甚至还请求辞去丹杨尹这一职务，只可惜这些请求都未能得到应允。
更为糟糕的是，当时统领军队隶属于徐孝嗣麾下的虎贲中郎将许准，曾经积极地游说着徐孝嗣，认为眼下正是起兵废掉昏庸无道的萧宝卷、另立新君的绝佳时机。面对这样极具诱惑力的提议，徐孝嗣却表现得犹豫不决，迟迟未能下定决心采取实际行动。与之形成鲜明对比的是，萧宝卷之所以一直没有对徐孝嗣动手，仅仅只是因为觉得他身为一介文官，而且其政治立场并不明确。但是，萧宝卷身边那些得势的宦官和宠臣们可不会轻易放过徐孝嗣，他们不断地在皇帝耳边进谗言，极力劝说萧宝卷除掉徐孝嗣以绝后患。同年十月乙未日（公元 499 年 12 月 11 日），深秋的寒风裹挟着丝丝凉意，吹过华林省那巍峨的宫殿。这一天注定成为历