东海之滨，蓬莱仙岛被云雾缭绕，仿佛天地间遗落的玉璧。俞伯牙立于悬崖之巅，指尖轻抚瑶琴，琴声如流水般倾泻而下，与海浪的轰鸣、海鸟的啼鸣交织成一片。他闭目凝神，感受着自然万物在琴弦上的呼吸，却始终觉得琴音中缺少了某种灵魂的震颤。
“琴师，你可知这海浪之下，藏着上古琴魂的叹息？”苍老的声音自风中传来，伯牙猛然睁眼，只见一位青袍道人踏浪而来，衣袂翻飞间，竟踏着波涛而行。道人自称“成连”，是琴道宗师，他凝视着伯牙的琴，眼中闪过一丝惋惜：“你虽通技法，却未悟‘移情’之境。唯有将心灵融入天地，方能奏出真正的天籁。”
成连带着伯牙深入蓬莱腹地，留他独坐山洞。数日间，风雨交加，雷电轰鸣。伯牙在狂暴的自然之力中挣扎，忽见洞内石壁上浮现出万千山川河流的虚影，琴弦自鸣，竟化作一条青龙与一条白虎，在他周身盘旋。他心中涌起前所未有的悲怆，琴声随之如山崩海啸般倾泻而出。待风雨止歇，成连现身笑道：“你已得琴魂，此曲可名《水仙操》。”
数年后，伯牙以晋国使者身份出使楚国。归途中，船行至汉江口，暴雨突至。他立于船头，任凭雨水打湿衣襟，指尖在琴弦上无意识地游走，竟奏出一曲《高山》的雏形。忽闻岸上传来清越的赞叹：“巍巍乎若泰山！”循声望去，但见一樵夫披蓑戴笠，腰间别着板斧，正痴痴望着江面。
“汝亦知音？”伯牙惊问。
钟子期朗声笑道：“我非知音，乃天地之耳！君之琴声中，有山川的魂魄在恸哭。”他上前一步，与伯牙对坐江畔，任凭江水打湿衣袍。伯牙再奏《流水》，子期抚掌叹道：“洋洋乎若江河！君之曲中，藏着江河万里、草木生息的私语。”
两人在月光下畅谈，从《诗经》的雅韵到楚地的巫傩之音，从伯牙幼年学琴的艰辛到子期家族世代守护乐谱的使命。子期取出家传古琴，琴身刻着“天籁”二字，琴弦竟是取自江心明月珠与山巅千年古藤。当两琴共鸣，江水骤然平静，两岸的花草随之轻颤，仿佛也在应和这跨越千年的知音之约。
子期归家后，将伯牙所奏之曲记录于竹简，却不知此谱暗藏玄机。其母见状大惊：“此乃‘天籁录’，历代乐官皆因妄动此谱而遭反噬！你与伯