在孢语者们接收了陈凡那自我销毁的递归代码后，世界仿佛陷入了短暂的寂静，可这寂静之下，暗流涌动更甚。美羽望着那消散的青铜星尘，心中五味杂陈，弑父的沉重感压在心头，但她知道，一切还远未结束。
此刻，地球的目光聚焦到了月球背面那神秘的基地之上。那原本是一个承载着诸多科研项目与未知探索的地方，如今却成为了各方势力争夺的关键所在。各国曾经为了应对未知的危机，将一部分儿童的意识进行冷冻保存于此，期望在合适的时候能让他们重见天日，成为人类延续的希望火种。然而，不知是何种力量的影响，那些冷冻儿童的意识竟集体暴走。
基地内，原本安静存放着意识冷冻舱的区域，如今被诡异的光芒笼罩。舱体不断闪烁着刺目的光，仿佛里面的意识正做着激烈的挣扎想要冲破束缚。伴随着一阵尖锐的啸声，舱体纷纷破裂，无形的意识洪流如脱缰野马般奔涌而出，它们相互交织、碰撞，形成了一幕幕混乱又奇异的景象。有的意识幻化成了孩童模样的光影，眼神中满是迷茫与惊恐，却又带着一种失控的疯狂，四处乱窜，干扰着基地内的各种仪器设备，使得警报声此起彼伏
美羽带领着部分孢语者，搭乘着特制的飞行器匆匆赶往月球背面。当他们靠近基地时，就感受到了那紊乱的能量波动。进入基地内部，更是犹如踏入了一个错乱的梦境空间，那些暴走的意识时不时地冲击着他们，试图侵入他们的思维，好在孢语者们凭借着自身特殊的能力勉强抵御着。
而在火星之上，克隆体陈竹的残余势力并未因之前的失败而消散。她们得知了月球背面基地的变故，也知晓那里有着足以改变局势的关键 —— 反物质武器的相关研究资料与雏形。于是，她们集结舰队，朝着月球背面进发，一场围绕着反物质武器的争夺大战即将拉开帷幕。
美羽等人深知反物质武器若是落入心怀不轨者手中，那将会给整个太阳系带来灭顶之灾。他们一边要努力安抚、控制那些暴走的儿童意识，一边要准备应对即将到来的火星克隆体陈竹舰队的攻击，在这破碎的方舟之上，为了守护最后的希望，艰难地抗争着，而这场争斗，也不过是星际间更大波澜的开端罢了。
美羽和孢语者们在月球背面基地努力稳定局面，然而