降低病虫来源；冬季深翻土壤，阻止虫卵在土中越冬。鼓励两茬种植作灸用，提前于5月上中旬采收，规避蚜虫爆发期；种植5年或6年后，宜与其它作物轮作，防止连作障碍。
3物理防治：3月中下旬至6月蚜虫发生期，设置黄色粘虫板（黄板）诱杀蚜虫，每667平方米设20-25个，固定于高出植株10-20厘米处；4月下旬至8月，每间隔100-120米使用1盏频振式杀虫灯诱杀害虫。
4生物防治：选用枯草芽孢杆菌、白僵菌、苦参碱、印楝素、鱼藤酮等生物农药，参照说明书使用方法防治病虫害；注意利用蚜虫的天敌控制蚜虫。
5化学防治：病害主要有白粉病、病毒病等，虫害主要有蚜虫、红蜘蛛等。对于蚜虫、红蜘蛛等害虫，可选用符合有关农药管理规定的农药进行防治。不应使用国家禁用的农药品种。
采收加工
1采收时间与方式：艾草一年可收获1-3茬，为保障药用或灸用品质，每年宜收获1-2茬。仅收获1茬的艾叶适用于药用与灸用，采收时间应在6月上旬；收获2茬或3茬的艾叶适用于灸用或它用，第一茬宜在5月上旬或5月中下旬收割，第二茬在7月下旬至9月上中旬采割，第三茬10月至11月下旬适时采收。每茬应在主茎尚未分出侧枝及未开花时，趁晴天用镰刀贴地或近地收割，摊至原地，或尽快就地摘取鲜叶；较平坦地块也可用机械采割，或用脱叶机于田间脱取鲜叶。
2干燥与脱叶：根据应用时是否带茎杆，或仅用干燥艾叶，选用以下两类干燥脱叶方式：
1将人工或机械脱取的鲜艾叶，就近于洁净水泥地晒场摊薄晾晒至干，不可堆沤；阴天或雨天置干燥的室内晾干时，每隔1-2天翻动1次，至七成干后4-7天翻动1次。阴干晒干均可，以阴干品质较好。
2将植株采割后，就地就近摊薄晾晒，不可堆沤，至八成干后，在早晨或天黑前捆扎，在鄂北较干燥地区移至室内堆置至全干，在其他湿度较大的地区移至室内，直立倚靠至完全阴干；雨天置干燥的室内晾干，每隔1-2天翻动1次，至七成干后4-7天翻动1次。全干后，除去杂物，用脱叶机脱叶或人工摘叶；或除去杂物后，不脱叶使用干燥全株。
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