在联盟全面实施综合应对方案后，各个领域逐渐有了新的进展。负责基因不稳定问题研究的科研小组取得了突破性成果。他们发现，基因变异生物体内存在一种特殊的“熵变因子”，这种因子并非自然产生，而是受到某种外部能量干扰后，在基因重塑药剂的作用下被激活，从而导致基因不稳定。经过无数次实验，科研小组研发出一种“基因稳定剂”，能够有效中和“熵变因子”，恢复基因的稳定性。
联盟迅速组织力量，对受影响的星球展开救援行动。飞船满载着“基因稳定剂”穿梭于各个受灾星球之间，对变异生物进行针对性治疗。随着“基因稳定剂”的广泛应用，生物的基因不稳定现象得到了有效控制，生态系统开始逐渐恢复生机。原本充满混乱和危险的星球，再次响起了生物的欢鸣声，绿色植被重新覆盖大地，河流也恢复了往日的清澈。
神秘信号破解小组也传来好消息。他们通过对大量信号数据的深度分析，结合古老文明传承下来的部分知识，终于成功破解了神秘信号的部分编码。原来，这些信号来自一个遥远的星系文明，他们自称“星渊族”。信号的内容并非敌意的宣告，而是一种求救信号。星渊族正遭受一种未知的、强大的宇宙灾害侵袭，这种灾害以一种类似熵增的方式，逐渐吞噬他们的星系。他们试图向周边星系发送信号，寻求可能的援助或合作，共同对抗这场灾难。
得知这一消息后，联盟内部产生了不同的看法。一部分人认为，星渊族的遭遇与联盟当前面临的危机可能存在某种关联，应该谨慎对待，在彻底弄清楚情况之前，不宜贸然提供帮助。另一部分人则主张发扬联盟团结互助的精神，伸出援手。毕竟在宇宙中，任何文明都可能面临未知的灾难，帮助星渊族也是在为联盟的未来积累善缘。
就在联盟讨论如何应对星渊族的求救时，负责探索神秘能量场的科研小组却遇到了新的困境。他们发现，神秘能量场似乎拥有一种自我修复和进化的能力。每当科研设备靠近进行探测时，能量场便会释放出更强的干扰波，损坏设备。而且，能量场的范围在不知不觉中开始缓慢扩大，对周边星系的影响愈发明显。一些靠近能量场的星球，其磁场和气候开始出现异常变化，给当地居民的生活带来了极大困扰。
与此同