太原起义的军队中选拔出三万禁军驻扎在皇城北面，负责皇宫的守卫工作，称为元从禁军，又称为北衙。专职守卫皇宫的禁军不在南衙十六卫编制中，由皇帝直接掌握和控制，意在“文武区别、更相检伺。”
因禁军总部设在皇宫北面的西内宛里，一方面抵御北方游牧民族的入侵，一方面镇摄京畿，弹压市面，是稳定长安城的主要守卫力量之一，皇帝可不经过相府直接调动，故称北衙。
虽然经过武德九年突厥入侵，北衙的元从禁军消耗损失巨大，但这几年又经过补充，人数不减反增，保持在四万到五万之间。原本北衙禁军有羽林、龙武、神武、神策四军，后来李世民又陆陆续续增加了几个内府。
其中左屯卫翊府就是新增的北衙禁军的一支，有近五千人，平时负责守卫长安城北边靠西的光化门、景耀门、芳林门，还有西面的开远门和金光门，一共五座长安城门。
南衙十六卫每卫主官都设有正三品的大将军，很多大将军都拥有从一品的国公爵位，像尉迟敬德、柴绍、秦琼、程咬金、张公谨、侯君集等，但十六卫的大将军更像是一种显示尊崇身份的筹功职位。
只是地方折冲府番上的时候，负责管理和训练，若要实际统领军队，一般都是外放出去守卫边疆重镇的时候，像剧中的侯君集，李绩，平时一个在襄阳平乱，一个在北地守边，一旦调到京城就担任十六卫的大将军，却不能在京城统兵。
十二卫虽然管理着天下的众多折冲府，但除了左右卫之外，其他大多并没有实际调兵权和统领常备军队，统率的内府也基本上都是形同虚设，有编无员。
实则是李世民将这部份该有的人员，调整到北衙直属自己管辖的禁卫军中了。
而直属皇帝的北衙禁军虽然实际掌控四五万常备军队，但却并没有设置品级特别高的类似大将军、将军等职位，而正四品下的中郎将一职，就已经是一军最高军事主将了。
和南衙的军事主官地位尊崇却无实权相反的是，禁军的统领们虽掌实际兵权，但地位却不高，这也算是一种变像的制衡。
南衙的主官动不动就是功勋卓着，在军中甚有威望的老将，占据高位，却没有做乱的力量；
而北衙禁军的主将有做乱的力量，