心火亢盛所致的心烦失眠时，缪希雍认为黄连可与朱砂、生地黄等配伍。朱砂具有重镇安神的作用，生地黄能够清热凉血、滋阴生津，与黄连配伍，可共同发挥清心泻火、安神定志的功效。然而，他同时强调，黄连苦寒之性峻烈，容易损伤脾胃阳气，因此脾胃虚寒者应慎用。为了让后世医家更加深刻地认识到这一点，他列举了多个临床案例，详细描述了脾胃虚寒者误用黄连后出现的不良反应，如胃脘冷痛、腹泻、食欲不振等症状，使医家们在临床应用黄连时能够更加谨慎、准确地把握其适用范围和禁忌。
在药物功效主治方面，缪希雍同样有许多创新的认识和见解。以当归为例，他认为当归味甘、辛，性温，归肝、心、脾经。其甘温质润，长于补血，为补血之圣药；辛行温通，又能活血止痛，是妇科调经之要药。同时，他还指出当归还具有润肠通便的作用，可用于治疗血虚肠燥便秘。他进一步阐述了当归在不同方剂中的配伍应用及其原理。在经典方剂四物汤中，当归与熟地黄、白芍、川芎配伍。熟地黄滋阴补血，白芍养血敛阴，川芎活血行气，与当归共同发挥补血养血、调经止痛的功效，成为治疗血虚诸证和妇科月经不调的经典方剂。据当时的临床统计数据显示，在使用四物汤治疗月经不调的患者中，约80以上的患者症状得到了明显改善。在生化汤中，当归与川芎、桃仁、炮姜等配伍，具有养血祛瘀、温经止痛的作用，常用于产后恶露不行、小腹冷痛等症。他对当归功效主治和配伍应用的详细阐述，使后世医家对当归的认识更加全面、深入，为临床准确应用当归提供了更为精准的指导。
缪希雍十分强调药物的炮制和配伍。他认为，药物的炮制方法直接影响其疗效，不同的炮制方法可以改变药物的性味、功效和归经，从而满足不同病症的治疗需求。以地黄为例，生地黄性寒，具有清热凉血、养阴生津的功效；而经过炮制后的熟地黄，性微温，具有滋阴补血、益精填髓的作用。他详细阐述了地黄炮制的具体方法和原理，如地黄的炮制需经过九蒸九晒，每一次蒸制和晾晒的时间、火候都有严格的要求。在蒸制过程中，地黄的化学成分会发生变化，其性味也会逐渐由寒转温，功效也相应地从清热凉血转变为滋阴补血。这种细致入微的炮制方法，能够使地黄更好地发挥其药用价值，