现代人起源于非洲东部和南部的一个有力证据是基因数据的分析结果。
基因分析的目的在于判断已有的数据更符合多地区起源模型还是简单的非洲起源模型。
很快，你们科学家就确定后者能更好地解释现有的基因数据。
但在上世纪90年代，研究者从一些现代非洲人体内发现了一些特殊的等位基因。
他们发现，这些等位基因上的许多突变，都与其他现代人的等位基因相关。
这些相关基因的广泛存在说明，这些等位基因应当存在了很长时间（20万或30万年以上）。
也就是说，这些“古老的”基因应该之前就已经存在了。
部分基因学家认为，这些等位基因的存在反映出，
原始的非洲人与演化后的非洲人之间曾发生过基因交流。
那么，现代人的这些等位基因是如何产生的？它们的存在又能说明什么呢？
在过去20年间，生物学家建立了更加复杂的模型，以模拟人类基因组的变化过程。
现在，越来越多的科学家认同，无论原始人类的人口规模如何变化，
相比起简单版本的非洲起源说，基因交流曾经重复发生的理论能更好地解释现代人的基因多样性。
但问题在于，这些模型十分复杂且很难给出具体的演化过程。
如何从无数的情景模拟中选出能够代表过去30万年甚至100万年间人口结构的模型？
此时，考古学、古人类学、地质学、古生态学和古气候学的数据就显得尤为重要。
综合考虑各学科数据能够缩减选择范围，帮助我们找出最可能的情景。
根据我们对人类历史上种群动态的了解，目前认为最接近真实情况的情景应该是，
结构化的人类种群中逐渐演化出现了现代特征。在这个结构化种群的模型中，
人类基因的多样性从人类祖先直接遗传而来。
目前最可能的一种推测是，过去存在大量的文明和人类种群，人类的不同种触或交流，
但随着环境变化和种群隔离的周期性发生，每一个种群又具有其独特的基因、形态和文明特征。”