入胃经，使其敷布于十二经，退其淫热，佐以黄连，犀角(水牛角代)黄芩泻心肺之火于上焦，丹皮、栀子、赤芍泄肝经之火，连翘，参解散浮游之火，生地，知母抑阳扶阴，泄其亢盛之火，而救欲绝之水，桔梗、竹叶载药上行，使以甘草和胃也，次方为大寒解毒之剂，故重用石膏，先平甚者，而清经之火自无不安矣。
本方由白虎汤，犀角地黄汤，黄连解毒汤加减组成;
第一组：重用石膏配知母，甘草，竹叶，意在清热保津，使肺胃气分热清，则壮热烦渴等可消除;
第二组：黄连、黄芩、栀子、连翘是仿黄连解毒汤，意在清泻三焦火热，使热清毒解，则清症随之而解;
第三组：水牛角、地黄、丹皮、赤芍、参，即犀角地黄汤加味，是为了清热解毒，凉血救阴而设，是血分热清，则发斑吐扭，舌绛，神昏等症可解，再配桔梗取其载药上行。可知本方虽三方合成，但以白虎汤清阳明经热为主，配以泻火，凉血，相辅而成，共凑清瘟败毒之功。
清瘟败毒散主要用在畜禽温热病的治疗上，具有清热泻火、凉血解毒之功效。在不同动物身上，能有效治疗的病症如下所示。
猪：主要用于猪瘟、流感、无名高热、口蹄疫、伪狂犬、圆环病毒、传染性胃肠炎引起的高热、食欲不振、呼吸急促、便干尿黄、流泪、眼角分泌物多、腹部，耳根，四肢多处红紫等疾病的治疗。
牛羊：对病毒性口蹄溃烂、牛羊流行性感冒、牛恶性卡他性热、乳房炎和子宫内膜炎引起的败血型体温升高、羊瘟、羊快疫等病毒性疾病的防治效果显着。
禽类：用于新城疫、禽流感、鸡传染性法氏囊病、鸭病毒性肝炎、鸭瘟、鸭细小病毒、小鹅瘟、鹅细小病毒引起的家禽高热、精神沉郁、缩头垂翅、咳嗽呼噜、流泪、甩头、流鼻涕、产蛋下降、产畸形蛋、白壳蛋、薄壳蛋等，疗效显着。