却回复他说：“王尚父何必如此恭敬呢！我受命讨伐三个贼臣，你就是其中之一。如果你能够自我捆绑前往朝廷请罪，我不敢擅自做主处置你，会为你上奏请示皇上的意见。”王行瑜听后感到害怕，于是弃城逃走。武皇收复了邠州城并封存了府库中的财物，迅速将胜利的消息上报给朝廷。
不久之后，庆州上奏称王行瑜带着五百名家属逃到州界时，被部下所杀，首级被送往京城。武皇平定王行瑜之后，率军返回渭北驻扎，准备迎接接下来的战斗。十二月时，武皇在云阳驻扎，等待进一步讨伐凤翔的命令。乙未日，天子赐予武皇“忠贞平难功臣”的称号，并进封为晋王，增加了实封二百户。这是皇帝对武皇功绩的充分肯定，也是对他忠诚与勇猛的极高赞誉。
然而，武皇并未因此满足。他深知，李茂贞仍然是朝廷的一大隐患，必须尽快铲除。于是，他再次上表请求讨伐李茂贞，但天子却迟迟没有同意。武皇私下对诏使说：“观察皇上的意思，似乎怀疑我有其他打算。我还能说什么呢？但如果不铲除祸根，忧患将永无止境。”他的话语中充满了无奈与坚定。为了表明自己的忠诚与决心，他又上奏说：“我统领大军不敢直接前往朝廷觐见。”说完，便率军撤回。