来到最后一个环节，天宇三人已经先一步出发了，最后要选择自己的神奇宝贝进行马拉松赛跑，小智自然选择了皮卡丘，而小葵带着的搭档是小猫怪。
天宇本来是打算选梦妖的，但规则是神奇宝贝也要跟着跑，梦妖只能在天上漂浮着，最终天宇选择了身边跑步速度最快的蜥蜴王。
选择好神奇宝贝，三人便一块出发了。只不过比体能，天宇或许真的不是小智的对手，但没想到他连小葵都比不上。他们俩带着自己的神奇宝贝遥遥领先，天宇的蜥蜴王虽然不比他们差，但为了等他的训练家，不得不放慢速度，这倒是让天宇有些尴尬。
尽管天宇在最后时刻拼尽了全力，但在体能上还是不能和小智相提并论。最终的结果是小智拿到了冠军，小葵拿到了亚军，天宇只能拿个季军安慰一下了。后续接着是小刚和小光，其他人也陆陆续续的赶回来。
顺便一提，最后回来的居然是一开始有大优势的考平和武藏，就连体能最差的天天都要比他们快不少。
因为最后一个项目的逆转，让小智所在的红组拿到了最后的优胜。
随着最后一个比赛活动结束，意味着山梨博士组织的暑期讲座正式结束。虽然只是短短一个星期，但这个暑期讲座确实让大伙学到了很多，还交到了很多朋友。
山梨博士给每个人准备了纪念证书，最后一天晚上大伙还举办了篝火晚会，享受着最后的狂欢。
等到了第二天一早，众人向着山梨博士道谢后，和各种交到的朋友告别，一行人再度踏上他们的旅程。
再顺便一提，原本火箭队的武藏和伪装成工作人员的小次郎和喵喵，本来是打算趁着这个机会偷走山梨博士研究所的神奇宝贝。结果不知不觉就跟着乐在其中，忘记了本来的目的。等他们离开的时候才回想起，顿时追悔莫及，想要再回去也来不及了。
告别了山梨博士的研究所后，一行人选择的下一站是神和镇，参加神和镇举办的华丽大赛。
目前天宇和天天都集齐了四枚缎带勋章，小智有三枚缎带勋章，小光只有两枚缎带勋章。天宇已经不准备忍耐了，尽快参加完最后一场华丽大赛，集齐五枚缎带勋章。
在前进的路上，一行人碰到了许久不见的小望