宝可梦训练家不太一样，并非收服，而是在需要时借助它们的力量。
因此忍者们并没有将这些半驯化的野生宝可梦一起带走。
但因为适应人类的驯养，这些宝可梦在忍村的居民离开后还是选择继续居住在村子里。
所谓的忍者村也就逐渐消失了……留下的无人村变成了一处特殊的【宝可梦忍村】。
后来联盟在这块地上建设了用于培育宝可梦的野生原野区，并且引进了大量其他地区收容的宝可梦……
包括从猎人组织里解救出来的宝可梦、或是在野外失去双亲的孤儿宝可梦……也有被训练家遗弃的宝可梦……
总之成为了一处种群丰富的宝可梦保育园！
这时候问题就出现了……那片忍者村残存的宝可梦大多是性格凶悍的毒虫，毒蛇类宝可梦……它们在生态圈中往往是捕食者的地位。
本来捕食者的数量会受到自然界中的猎物数量的限制保持在较低水平……
但在联盟主动引进了大量的外来宝可梦之后……食物的增加让它们开始迅速繁殖起来。
过多的捕食者出现，这对恢复宝可梦的种群是不利的！
巴奥巴园长很快意识到这个问题，并且迁移走了大部分的忍村宝可梦，只留下极少部分。
毕竟原野区里宝可梦的数量调控不需要依靠食物链……而是由训练家去控制。
比如小智的三十只肯泰罗……
但是，就在一周前……巴奥巴从好友阿桔的口中，听说了对方说了些有关于女儿的事情……
当时的阿桔露出一副十分苦恼的样子，说是自己九岁的女儿阿桔不知道从哪里听来了关于废弃忍者村的事情……
一直吵闹着要帮助被迫离开家园的忍村宝可梦重返故乡……
并且认为由一群旧时代忍者伙伴们组成的【宝可梦忍村】……非常地酷！
好吧——听上去确实挺酷的。
但这不是重点……重点是阿杏把拆散宝可梦忍村的【罪名】安在了巴奥巴园长的头上。
还扬言要为忍村的宝可梦“讨回公道”！
而阿桔一家都是伊贺流忍术的传承者……阿杏自然也不例外。
虽