兄弟为了寻找神秘的贤者之石而展开旅程。哥哥爱德华15岁,是有史以来最年少得到国家錬金术师的资格的天才的錬金术师；弟弟阿尔丰斯虽然拥有威武的铠甲姿态,但却是位善良的14岁少年。
二人来到东部边境市镇里奥尔,在那里,他们目睹了称为太阳神雷特代理人的柯奈罗主教的奇迹之业
艾尔林克兄弟与主教在雷特教会的秘密地下室为争夺贤者之石而决战，但就在这时候,听说主教有危险而前来的雷特信徒来到闯入干扰，艾尔林克兄弟逃到镇上,被深信柯奈罗的村民发现包围，被奇迹之技而唤醒的雷特神像打倒阿尔丰斯,爱德华被捕后再被带到柯奈罗面前
在旅途中经过的街角古书店里,爱德华和阿尔丰斯找到了錬金术的入门书，想起了以前用这书学习錬金术的时候,那时两个人还很小的时候,一起在利赞布鲁村生活的岁月，他们为了想看见妈妈的笑脸,为了这心情,竞争着修练錬金术
艾尔林克兄弟为了成为国家錬金术,离开出生的故乡利赞布鲁展开旅程,在途中听说了有关錬金术师玛吉哈尔的传言，于是决定前往他所居住的村子，可是那村子却流传着死人接连出现袭击村民的谣言
为了成为国家錬金术师,爱德华和阿尔丰斯向着中央进发，但在快要抵达时,却收到洛伊马斯坦中佐的报告电话,突然命令他们坐上接着的列车，原来这列车上戴着与家人旅行中的哈克罗将军
国家錬金术师资格试临近,在马斯·灰兹介绍下,爱德华和阿尔丰斯寄居于第一位成功做出生体錬成的\"缀命之錬金术师\"肖·塔卡家里，二人得到肖·塔卡和他的女儿尼娜以及他们的爱犬亚历山大的鼓励每天努力学习，接着到了考试当日,爱德华和阿尔丰斯挑战这次的国家錬金术师资格试
爱德华12岁就成功通过了国家錬金术师资格试,成为有史以来最年少的錬金术师,并从马斯·灰兹那里收到象征着国家錬金术师的银色怀表，这除了象征着得到特权外,还意味着他正式成为军部的一员
在肖·塔卡的家举行了一个派对尼娜和亚历山大都玩得非常开心,可是,肖·塔卡却在为迫在眉睫的查定日而感到苦恼,走投无路
爱德华因为自己未能拯救尼娜而后悔万分,痛恨自